Desde a colonização até os dias de hoje os rios, riachos, vertentes, lagos e lagoas que compõe a atual região dos lagos tem grande importância. Para a economia a hidrografia vem sendo uma importante fonte de emprego para população e de recursos financeiro para as prefeituras. O desafio e preservar esse belo paraíso evitando a poluição e extração excessiva dos recursos naturais.
A região dos lagos é dividida em cinco principais regiões hidrográficas mostradas na tabela abaixo:
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Mapa das bacias hidrográficas:
Para mais informações, consulte: http://www.lagossaojoao.org.br/hidrografia-regional.htm